Im Backend nichts anklickbar seit 4.2.12

Nach dem update auf 4.2.12 war alles klar. Wie üblich die Updateprozedure durchlaufen und die Chaches geleert. Danach ging das Arbeiten im BE.
Heute morgen jedoch ist zwar Login möglich und das BE erscheint, aber außer Workspace-Umschalter sind alle andern Funktionen tot.
Wo könnte ich suchen?
Im IE bekomme ich folgene Fehlermeldung:

Details zum Fehler auf der Webseite

Benutzer-Agent: Mozilla/4.0 (compatible; MSIE 8.0; Windows NT 6.1; Trident/4.0; SLCC2; .NET CLR 2.0.50727; .NET CLR 3.5.30729; .NET CLR 3.0.30729; Media Center PC 6.0; .NET CLR 1.1.4322; InfoPath.2; SLCC1; Tablet PC 2.0)
Zeitstempel: Fri, 26 Feb 2010 09:03:10 UTC

Meldung: '}' erwartet
Zeile: 3126
Zeichen: 9
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/contrib/prototype/prototype.js

Meldung: Annahme ausgelöst und nicht aufgefangen.
Zeile: 44
Zeichen: 8
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/contrib/scriptaculous/scriptaculous.js?load=builder,effects,controls,dragdrop

Meldung: 'Prototype' ist undefiniert
Zeile: 27
Zeichen: 1
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/js/common.js

Meldung: 'Class' ist undefiniert
Zeile: 28
Zeichen: 1
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/js/sizemanager.js

Meldung: 'Class' ist undefiniert
Zeile: 28
Zeichen: 1
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/js/toolbarmanager.js

Meldung: 'Class' ist undefiniert
Zeile: 34
Zeichen: 1
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/js/modulemenu.js

Meldung: Das Objekt unterstützt diese Eigenschaft oder Methode nicht.
Zeile: 28
Zeichen: 1
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/js/iecompatibility.js

Meldung: 'Class' ist undefiniert
Zeile: 33
Zeichen: 1
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/js/shortcutmenu.js

Meldung: 'Class' ist undefiniert
Zeile: 32
Zeichen: 1
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/js/clearcachemenu.js

Meldung: 'Class' ist undefiniert
Zeile: 32
Zeichen: 1
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/js/backendsearch.js

Meldung: Das Objekt unterstützt diese Eigenschaft oder Methode nicht.
Zeile: 780
Zeichen: 4
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/backend.php

Meldung: Objekt erwartet
Zeile: 233
Zeichen: 6
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/backend.php

Meldung: Objekt erwartet
Zeile: 321
Zeichen: 6
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/backend.php

Meldung: Objekt erwartet
Zeile: 365
Zeichen: 6
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/backend.php

Meldung: Objekt erwartet
Zeile: 475
Zeichen: 6
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/backend.php

Meldung: Objekt erwartet
Zeile: 703
Zeichen: 6
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/backend.php

Meldung: Objekt erwartet
Zeile: 583
Zeichen: 8
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/backend.php

Meldung: Objekt erwartet
Zeile: 567
Zeichen: 8
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/backend.php

Meldung: Objekt erwartet
Zeile: 255
Zeichen: 6
Code: 0
URI: http://www.bg-metall.de/typo3/backend.php

Fehler gefunden:
Die Datei prototype.js war nur bis Zeile 3126 hochgeladen worden.
Allerdings hatte ich Probleme, diese mit FileZilla korrekt hochzuladen. Immer wieder fehlten die letzten paarhundert Zeilen! D.h. die Datei verlor unterwegs einen Teil#paralyzed#

Erst als ich die defekte Datei im Editor mit dem kompletten Inhalt füllte und danach zurückspielte, funktionierte der Upload korrekt.