Probleme mit Header nach Update auf 6.1.7

Guten Tag - heute Morgen habe ich eine Kundenseite auf die Version 6.1.7 geupdatet.
Soweit fast alles in Ordnung - ausser:

Der Headerbereich wird nicht mehr korrekt dargestellt, bzw. es werden einzelne vorher integrierte Elemente einfach ignoriert.

Ausgabe heute

<div id="header"><a href="index.php?id=4">Startseite</a>&nbsp;&#124;&nbsp;<a href="index.php?id=36">Angebot</a>&nbsp;&#124;&nbsp;<a href="index.php?id=8">Über uns</a>&nbsp;&#124;&nbsp;<a href="index.php?id=41">Links</a>&nbsp;&#124;&nbsp;<a href="index.php?id=33">Kontakt</a></div>

Ausgabe vorher (korrekt)

<div id="header"><div id="topnav"><a class="skip" href="#navigation" title="Direkt zur Navigation springen">Zur Navigation springen</a><a class="skip" href="#content" title="Direkt zum Content springen">Zum Content springen</a><strong>Startseite&nbsp;&#124;&nbsp;</strong><a href="index.php?id=36">Angebot</a>&nbsp;&#124;&nbsp;<a href="index.php?id=8">Über uns</a>&nbsp;&#124;&nbsp;<a href="index.php?id=30">Links</a>&nbsp;&#124;&nbsp;<a href="index.php?id=7">Kontakt</a></div><a href="http://www.abc.ch" target="_self"><img src="fileadmin/img/Logo.jpg" alt="wieauchimmer" /></a></div>

Wo sind die "verschwundenen" Elemente hingekommen, bzw. wieso wird ein Teil der Inhalte nun einfach ignoriert? Über Ideen / Tipps freue ich mich sehr.
Cache wurde geleert, Database Compare, etc auch vorgenommen.

Danke und liebe Grüsse

Möglicherweise hat sich eine Extension an der vorherigen Ausgabe beteiligt, die nicht kompatibel mit TYPO3 6.1.7 ist?

Soweit ich sehen kann - nein...
Es scheint, als würde ein Teil des Codes einfach ignoriert werden.

Hier noch die Angaben aus dem Template (header)

#############################################
# +ext Header (temp.header )                #
# YAML for TYPO3, Autoparser, Version 4.5.0 #
#############################################
#### **Search-Box begin**
#### Delete the lines from #### **Search-Box begin** to #### **Search-Box end**
#### If you don't want to appear the search-box in the header
plugin.tx_macinasearchbox_pi1 {
  pidSearchpage = 10
  templateFile = fileadmin/template/searchbox/template.htm
}
[globalVar = GP:L = 1]
#### We need a different searchbox-template for english language.
plugin.tx_macinasearchbox_pi1.templateFile = fileadmin/template/searchbox/template-en.htm
[global]
temp.header = COA
temp.header.10 < plugin.tx_macinasearchbox_pi1
#### **Search-Box end**
temp.header.20 = HTML
temp.header.20.value = <div id="topnav">
temp.header.30 = HTML
temp.header.30.value = {$headerSkiplinkHtmlCode}
temp.header.40 = HMENU
temp.header.40 {
  special = list
  special.value = {$headerNavigationIncludeList}
  1 = TMENU
  1 {
    noBlur = 1
    wrap = |
    NO = 1
    NO.ATagTitle.field = abstract // description // subtitle
    NO.linkWrap = |&nbsp;&#124;&nbsp; |*| |&nbsp;&#124;&nbsp; |*| |
    NO.allWrap = |
    NO.stdWrap.htmlSpecialChars = 1
    CUR < .NO
    CUR = 1
    CUR.allWrap = <strong>|</strong>
    CUR.doNotLinkIt = 1
    CUR.stdWrap.htmlSpecialChars = 1
  }
}
temp.header.50 = HTML
temp.header.50.value = </div>
temp.header.60 = HTML
temp.header.60.value = {$headerImageHtmlCode}


[globalVar = TSFE:id = 28]
temp.col1_content.10 >
temp.col1_content.20 >
[global]

Ja, wie gesagt, ab und zu mal in die TSRef (der jeweiligen TYPO3-Version schauen)

"Note: This content object was deprecated since TYPO3 4.6 and has been removed in TYPO3 6.0. Use the content object “TEXT” instead!"

Mach also aus HTML TEXT in deinem TS, und deine Seite ist wieder ok.

Vielen Dank - ich probiers gerne aus.